同一DNA在不同细胞中命运各异：AlphaGenome 2 将预测推进到细胞层级

**导语：** 同一套基因组序列，在肝细胞、神经元与免疫细胞中却呈现不同表达程序。AlphaGenome 2 的核心进展，在于把基因调控预测从“序列—功能”的静态映射，推进到“序列—细胞上下文—调控结果”的层级建模。

从序列到细胞语境

DNA并非孤立指令，其命运受启动子、增强子、转录因子、染色质开放性和三维构象共同塑造。同一变异在一种细胞中可能影响增强子活性，在另一种细胞中则因调控元件沉默而无显著效应。AlphaGenome 2 若能在细胞类型层级预测表达、剪接及调控活性，意味着模型开始显式处理细胞特异性上下文，而非仅给出全局平均效应。

价值与边界

这一方向对非编码变异解读、疾病机制研究和靶点发现具有直接意义：研究者可先定位“在哪些细胞中起作用”，再设计实验验证。但细胞层级预测仍受训练数据覆盖、细胞状态动态性和个体遗传背景限制，预测结果应视为可检验假设。真正的突破不只在模型精度，更在于能否稳定区分细胞类型特异性效应，并与湿实验形成闭环。对基因组学而言，AlphaGenome 2 提示：理解DNA，必须同时理解它所在的细胞。